蔓菁基因组Hi-C测序数据

2018年产生的蔓菁基因组序列,经过Hi-C测序后的生物信息学分析可以实现将初步组装的基因组草图中的大部分序列定位到染色体,并能够确定这些序列在染色体上的顺序和方向,为获得高质量的序列图谱奠定重要的基础。故课题组通过该技术把蔓菁基因组序列草图中的序列分别划分到同该物种染色体数目一致的群组(Group)中,并且确定每一群组中所有序列的顺序(Order)及方向(Orientation),之后可以结合参考蔓菁基因组、转录组组装序列(EST序列)、近缘物种及遗传图谱数据对划分群组的准确性及序列之间的顺序和方向进行评估。

doi: 10.11888/Ecolo.tpdc.271069 220 0 2020-10-25

植物基因组重测序数据(2020)

为研究蔓菁的扩散与人类活动之间的关系,我们将来自青藏高原及周边区域,以及巴基斯坦,印度,尼泊尔,德国,日本等地的蔓菁品种进行重测序,同时对基因家族进行聚类,以及特有、共有基因和基因家族统计,此外还将进行基因家族扩张收缩分析,系统发育树的构建,全基因组复制事件等分析。目的是解析人类活动和区域气候环境双重压力下,高原各地的传统蔓菁品种适应高原的分子基础。因此这项研究有助于揭示蔓菁适应高原生态环境的适应性机制以及在进化过程中人工驯化和人类选择对其遗传分化的影响。

doi: 10.11888/Socioeco.tpdc.271065 1083 1 2020-10-25

哈萨克斯坦首都努尔苏丹城市生态屏障空间分布数据(2018年)

本数据为2018年哈萨克斯坦首都努尔苏丹生态屏障空间分布图,图中的地物类型主要包括防护林、道路、建筑、湖泊以及河流等。数据源为2018年8月的四景哨兵影像,分辨率为10米。同时,叠加OpenStreetMap(OSM)全球地物矢量图。该数据集经过校正处理,较为准确。防护林斑的提取通过目视解译与实地野外调查相结合,精度较高。数据反映了哈萨克斯坦首都努尔苏丹城市生态屏障空间分布现状,同时,对于长时间的防护林时空格局的变化监测,也具有重要的参考价值。

3353 1 2020-06-28

青海牧区传统放牧牦牛体重监测数据集(2018)

本数据集内容为2018年青海牧区11个高寒草甸典型区域内代表性牦牛群体体重与体尺(体高、体长、胸围、管围)性状的测定结果,所有元数据来源于中国科学院西北高原生物研究所生态中心高原动物生殖生物学学科组与青海省畜牧兽医科学院等单位联合开展的青海牧区传统放牧牦牛体重监测工作。数据集共包含1个工作簿11个工作表,工作簿名称为《青海牧区传统放牧牦牛体重监测数据集(2018)》,各工作表名称和内容分别为: 1.海晏哈勒景:海北藏族自治州海晏县哈勒景蒙古族乡167头牦牛体重、体尺数据;2.祁连默勒:海北藏族自治州祁连县默勒镇69头牦牛体重、体尺数据;3.祁连野牛沟:海北藏族自治州祁连县野牛沟乡42头牦牛体重、体尺数据;4.祁连央隆:海北藏族自治州祁连县央隆乡104头牦牛体重、体尺数据;5.祁连峨堡:海北藏族自治州祁连县峨堡镇28头牦牛体重、体尺数据;6.天峻新源:海西蒙古族藏族自治州天峻县新源镇38头牦牛体重、体尺数据;7.天峻龙门:海西蒙古族藏族自治州天峻县龙门乡100头牦牛体重、体尺数据;8.甘德岗龙:果洛藏族自治州甘德县岗龙乡36头牦牛体重、体尺数据;9.贵南塔秀:海南藏族自治州贵南县塔秀乡70头牦牛体重、体尺数据;10.河南柯生:黄南藏族自治州河南蒙古族自治县柯生乡73头牦牛体重、体尺数据;11.乐都达拉:海东市乐都区达拉乡50头牦牛体重、体尺数据。 本数据集通过对青海牧区各代表性区域内牦牛群体体重、体尺数据的测定,综合评估目前生态环境下高寒草甸传统放牧牦牛的生长性能。数据集可与《青海省畜禽品种志》(1983年)和《青海省畜禽遗传资源志》(2013年)中收录的1981年和2008年测定青海牦牛代表性群体生长性状进行比较,获得青海牧区传统放牧牦牛生长性能退化指数,从而有助于评估生态环境变化对于草食家畜生长与生产性能的影响。

doi: 10.11888/Ecolo.tpdc.270389 3512 1 2020-06-13

1980年以来青藏高原草地生产力数据

数据集包含1980,1990,2000,2010,2017年青藏高原草地产草量空间分布。基于中国科学院地理科学与资源研究所具有自主知识产权的生态水文动力模型VIP(Vegetation Interface Process) 模拟了青藏高原草地总初级生产力(GPP),利用经验系数估算了净初级生产力(NPP),将NPP换算为干物质,再根据根冠比估算了干草产量。空间分辨率1公里。该数据集将为草地资源管理、开发、利用以及“以草定畜”策略的制定提供依据。

doi: 10.11888/Ecolo.tpdc.270430 3694 352 2020-02-06

1980年以来青藏高原草地合理载畜量和超载程度

数据集包含2000年,2010年,2018年青藏高原县级理论载畜量数据和1980年, 1990年, 2000年, 2010年, 2017年县级超载程度。基于地理科学与资源研究所具有自主知识产权的生态水文动力学模型VIP(Vegetation interface process) 模拟的NPP数据计算了产草量数据(1km分辨率),按照县行政区域尺度,计算县域产草量,并根据载畜量计算标准(NY/T 635-2015)计算得到县域范围内的理论载畜量。基于县级实际载畜量数据,计算了超载程度。数据将为草地恢复、管理和利用策略的制定提供借鉴。

doi: 10.11888/Socioeco.tpdc.270347 2849 287 2020-01-26

植物de novo基因组数据(2019)

为了解析蔓菁如何、何时进入青藏高原,探讨蔓菁在青藏高原传播与驯化与早期人类活动的高原定居和古丝绸交流之间的关系,2018年6月,课题组利用三代基因组测序技术,对青海省囊谦县的蔓菁自交F1代品种进行全基因组测序和De Novo组装,得到组装基因组大小为409.69 Mb,Contig N50为1.21 Mb。这一结果可为研究植物扩散与人类活动之间的关系提供遗传基础。同时,这项研究有助于揭示人工驯化和人类选择对蔓菁的遗传分化的影响,以及蔓菁适应高原生态环境的适应性机制。

1760 1 2020-01-22

青藏高原生态要素数据(1990-2015)

本数据集是1990年至2015年青藏高原地区生态要素数据集,记录了青海西藏两省15个地级单元湿地、草地、林地、沙地四种类型用地每五年的面积占比变化情况。数据为excel文件,空间分辨率为地级行政单元尺度。该数据是根据青藏高原土地利用类型数据,通过计算每个地级单元面积内的湿地、草地、林地和沙地的面积占地级单元面积比例得到,数据集可用于青藏高原生态要素的变化分析研究,可以为城镇化与生态环境交互胁迫研究提供数据支撑。

3317 151 2019-11-19

全球重大林火灾害数据集 (2018.01-2019.06)

此数据集包含2018全年及2019上半年全球重大林火案例数据,包括2018年11月美国加州林火、2018年7月希腊阿提卡区林火及2019年3月中国山西省林火3个案例数据。具体数据包括:监测范围的火烧强度数据及灾前灾后植被指数变化数据。该数据集主要用于描述2018-2019上半年全球重大林火事件的发生、发展、影响及恢复,数据主要来源于NASA官网和EM-DAT数据库,在EXCEL和ArcGIS中运用统计与空间分析方法,对数据进行处理。数据来源可靠,处理方法科学严谨,可有效运用于全球(林火)灾害案例分析研究。

doi: 10.11888/Disas.tpdc.270203 3992 74 2019-09-15

牧区草原畜牧业政策形成与演化资料以及牧民对牧区草原畜牧业政策的感知和响应数据(2012-2013)

1、1954-2012年研究区草原畜牧业生产、管理政策主要包括:1)各种政策形成与演变的时间序列;2)主要政策中与牧户畜牧活动和草原管理利用相关的关键内容。 2、居民对牧区社会经济发展政策、草原管理制度、生态补偿政策、生态恢复工程、生态环境现状的感知和响应。

doi: 10.3972/heihe.0101.2014.db 3457 11 2015-06-25