西南高山峡谷哺乳动物物种与分布数据库(2017-2021)

“西南高山峡谷哺乳动物物种与分布数据库”包含横断山区哺乳动物名录、物种保护信息和国内分布信息。名录包含科名、属名、物种名;保护信息包含国家重点保护野生动物等级(2021)、CITES附录(2019)、IUCN红色名录(2021)、中国物种红色名录(2021);分布信息包括是否为中国特有种和物种在国内分布的省区。数据来源于中国科学院昆明动物研究所馆藏标本、项目执行期采集的标本、拍摄的红外相机照片、文献等。数据质量可靠。该数据库可为西南高山峡谷地区哺乳动物的研究和保护提供基础数据支撑。

doi: 10.11888/HumanNat.tpdc.272032 175 0 2022-02-16

西南高山峡谷两栖爬行动物物种与分布数据库(2015-2021)

本数据库为西南高山峡谷两栖爬行动物物种名录及其分布数据,包括本区域近300种两栖爬行动物的9544条分布记录。本数据库的物种分布信息主要获取自野外第一手数据及国内外著名动物网站,如物种2000。此数据主要涉及本地区两栖爬行动物的物种名、目科属名、省市县、小地名、经纬度、海拔等信息。此数据可用于探讨西南高山峡谷的两栖爬行动物区系、区划,亦为西南地区乃至东南亚地区的两栖爬行动物多样性、生态系统等研究奠定了坚实基础。

doi: 10.11888/HumanNat.tpdc.272031 64 0 2022-02-16

西南高山峡谷区生物多样性生态环境综合数据库

西南高山峡谷区是世界上生物多样性热点区域之一,建立生物-气候-地理数据库是研究该区域生物多样性的分布格局和形成原因的前提。在项目组提供的本区域7千余种植物分布信息的基础上,结合气候数据(来源于NCEP Reanalysis Products,https://psl.noaa.gov/data/gridded/data.ncep.reanalysis.surface.html, 1950-2020年平均值),建立西南高山峡谷区生物多样性生态环境综合数据库。生物数据包括动植物科属种名称、采集地经纬度信息等,地理数据包含海拔和坡度,气候数据包括降雨量和气温在内的24个指标。本数据库对研究该区域生物多样性分布规律、现状、形成机制和保育网络规划等提供支撑。

doi: 10.11888/HumanNat.tpdc.272005 96 0 2022-01-19

青藏高原南部孔桑桥遗址沉积物DNA分析数据

粳稻(Oryza sativa subsp. japonica)和籼稻(Oryza sativa subsp. indica)是亚洲栽培稻(Oryza sativa)的两个亚种,其中籼稻在距今4000年前后驯化于南亚北部,而后传入中国并广泛种植直至今天,但其传入中国的时间和路线至今不清楚. 本文对西藏自治区孔桑桥遗址(海拔2676米)出土的木炭、炭化种子和果实、植硅体以及堆积物古DNA进行了分析,发现了炭化稻颖果、水稻扇型和横排哑铃型植硅体,并在堆积物古DNA中发现了籼稻的特异性基因序列. 炭化稻的直接测年结果为公元8世纪前后,这是中国境内目前发现的最早的籼稻遗存. 木炭分析结果,尤其是大量乔松(Pinus wallichiana)木炭的发现,显示孔桑桥遗址所处位置无法满足籼稻种植的积温条件,遗址的籼稻系由低海拔地区交换而来. 结合考古资料和文献记载,我们认为,起源于南亚北部的籼稻,至晚在公元8世纪沿着蕃尼古道进入青藏高原南缘,并可能经由吐蕃继续东传进入内地,但未来还需更多的植物考古工作进行验证.

doi: 10.11888/HumanNat.tpdc.271940 13 24 2022-01-17

拉萨、日喀则考古遗址调查数据

对雅鲁藏布江中、上游干流及年楚河、多雄藏布、来乌藏布等支流区域展开调查,涉及西藏日喀则市南木林、江孜、亚东、吉隆、萨嘎、仲巴等县。在以往人类活动的空白区如错戳龙湖、多庆湖、仲珠谷、罗垄沟等多个地点发现新的人类活动遗迹点,在30余处地点采集到人类活动的重要石器证据,材质包括黑曜石、碧玉岩、水晶等。后续将通过类型学对这些石器的工艺和来源进行进一步分析,为揭示雅鲁藏布江中上游区域史前人类活动历史的时空变化及与周边文化技术交流情况具有重要意义。

doi: 10.11888/HumanNat.tpdc.271956 217 0 2022-01-17

主要家养动物表型数据(2021)

为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。我们于2021年在云南省采集了大额牛(独龙牛)血液、心脏、肝脏、脾脏、肺、肾、肌肉、脂肪、大肠、小肠、胃、睾丸组织17个个体共267份酒精、RNAlater保存或液氮冻存样品。本数据集包含样品物种、品种、详细采样地、性别、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以及个体照片。实体样品保存于中国西南野生生物种质资源库动物种质资源库。

doi: 10.11888/HumanNat.tpdc.271975 86 0 2022-01-12

受未来气候变化影响遗传多样性下降较大的关键物种和地区名录(2050、2070、2090)

1)数据内容:面对未来气候变化青藏高原10种两栖类爬行类遗传多样性的变化。2)数据来源及加工方法:基于青藏高原10种两栖爬行类条形码数据,结合SDM、MPTP approach等软件构建未来2050年、2070年、2090年等时期的遗传多样性及分布情况。3)数据质量描述:数据质量经过核查,分析数据人员经过实验室严格培训。4)数据应用成果及前景:发现分布于青藏高原北部的两栖爬行类需要在保护上给与更多的关注。

doi: 10.11888/HumanNat.tpdc.271960 179 0 2021-12-28

河湖源植被调查数据集(2020)

于2020年8月~9月在西藏自治区的河湖源区开展规范的野外调查,共调查样点25个,75个样方。数据集包括样点编号、样方号、经纬度、海拔、样方的地上生物量、物种数和盖度,数据格式为Excel表。调查样方面积为100cm*100cm,每个样点(site)有3个样方,命名为Plot1、Plot2、Plot3。数据全为实地采集和测量数据,野外调查按照植被调查规范确保数据质量完好。该数据集为合理利用草地资源提供理论依据,并为综合评估典型土地利用变化的环境效应提供数据支撑。

doi: 10.11888/Terre.tpdc.271919 392 0 2021-12-22

柴达木盆地沙蜥属和麻蜥属物种名录及其分布数据集(2007-2021)

1)数据内容:柴达木盆地沙蜥属和麻蜥属物种名录及其分布数据,包含纲、目、科中文名、科拉丁名、属中文名、属拉丁名、种拉丁名、种中文名、国家、省、市县、镇乡等分布地;2)数据来源及加工方法:基于2007至2021年间对柴达木盆地干旱荒漠区两栖爬行动物野外科考,记录该地区沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种组成和分布范围;3)数据质量描述:标本的调查、采集和鉴定人员均为专业人员,样品的采集信息经过核对,确保分布数据的质量;4)数据应用成果及前景:综合分析柴达木盆地沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种多样性和分布数据,可以为西北荒漠区及亚洲中部干旱区生物多样性编目提供重要资料,为评估生物多样性格局及制定保护策略提供科学依据。

doi: 10.11888/HumanNat.tpdc.271908 255 0 2021-12-10

青藏高原150例藏族人群全基因组芯片数据(2019-2021)

青藏高原是对人类生存最具挑战性的环境之一,被誉为地球的“第三极”。平均海拔在4000米以上,4000m的氧分压仅为海平面60%左右。高原缺氧对于人类生存是一个强烈的选择压力,大部分高原非适应性个体暴露于高原缺氧环境会导致红细胞数量增加(红细胞增多症)和红细胞积压(Hematocrit, HCT)水平升高。高原藏族遗传背景单一,长期高海拔环境对高原适应相关基因有正选择作用,造成不同海拔梯度在相关的单核苷酸多态性(SNP)存在稳定连锁遗传差异,适于研究高海拔适应性表型与基因型间的关联。本研究采用DNA微阵列(DNA Array)的方法,对比了150例高原藏族及非藏族东亚人的男性全基因组芯片数据,每个样品获取约70万位点(包括核基因组、线粒体DNA和Y染色体)分型结果,分析其差异SNPs、基因及信号通路,并检测高原藏族男性为适应高海拔低氧环境产生的分子水平的适应性进化特征。该数据有助于从核基因组角度解析藏族人群的遗传适应性,通过与高原周边人群数据的比较,可以较为全面地了解高原土著男性的适应性进化。为研究人类及生物进化、探究高低海拔人群的分子水平差异性、不同地理环境人群的同源关系和低氧对于基因的选择作用等提供基础的遗传参考数据。

doi: 10.11888/Others.tpdc.271881 369 0 2021-11-28