植物de novo基因组数据（2019）-时空三极环境大数据平台

为了解析蔓菁如何、何时进入青藏高原，探讨蔓菁在青藏高原传播与驯化与早期人类活动的高原定居和古丝绸交流之间的关系，2018年6月，课题组利用三代基因组测序技术，对青海省囊谦县的蔓菁自交F1代品种进行全基因组测序和De Novo组装，得到组装基因组大小为409.69 Mb，Contig N50为1.21 Mb。这一结果可为研究植物扩散与人类活动之间的关系提供遗传基础。同时，这项研究有助于揭示人工驯化和人类选择对蔓菁的遗传分化的影响，以及蔓菁适应高原生态环境的适应性机制。

数据使用方法

文件命名：基因组数据以文本格式存储，文件的名称为“20181106final.genome.fasta”，其中2018代表年，1106代表日期。
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文章的引用

1. Yang, Y.Q., Sun, X.D., Kong, X.X., Wang, C.T., Yang, Y., Yin, X., Yang, D.N., Duan, Y.W., & Yang, Y.P. (2019). The Turnip Genome Provides Insights into Independent Evolution of Glucosinolate Biosynthesis, Nature Communications, 34(4), 848-854.(查看)

数据的引用

段元文. (2020). 植物de novo基因组数据（2019）. 国家青藏高原科学数据中心, 2020.
[Duan, Y. (2020). Genomic data of plant de novo (2019). National Tibetan Plateau Data Center, 2020]

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关键词

学科：人地关系
主题：生物资源
地点：青藏高原
时间： 2018

空间位置

East: 97.00	West: 95.00
South: 31.00	North: 32.00

数据细节

文件列表
/20181106final.genome.fasta 大小：395.6 MB
时间分辨率：Yearly
空间分辨率：1km - 10km
大小：395.0 MB
浏览：1758 次
下载量：1 次
数据时间范围：2018-06-07 至 2019-01-07
共享方式： 申请获取
元数据更新时间：2021-04-19

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段元文

分发方：时空三极环境大数据平台

Email： poles@itpcas.ac.cn

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