1)数据内容:面对未来气候变化青藏高原10种两栖类爬行类遗传多样性的变化。2)数据来源及加工方法:基于青藏高原10种两栖爬行类条形码数据,结合SDM、MPTP approach等软件构建未来2050年、2070年、2090年等时期的遗传多样性及分布情况。3)数据质量描述:数据质量经过核查,分析数据人员经过实验室严格培训。4)数据应用成果及前景:发现分布于青藏高原北部的两栖爬行类需要在保护上给与更多的关注。
沈文菁
冬虫夏草(Ophiocordyceps sinensis)是一种经济价值极高的药用真菌,国家二级野生保护植物,主要分布于青藏高原以及周边高海拔地区的高寒草甸生境中,在该物种的传统产区,虫草收入是农牧民重要的经济收入来源,同时该物种是也青藏高原高寒草地生态系统的重要组成部分。 本数据根据已发表的野外调查和实验数据,以冬虫夏草干燥品腺苷含量为其质量标准,建立了一个综合生态位模型来模拟基准气候条件以及未来4种气候变化情景下4个时间段的冬虫夏草潜在分布区变化以及高质量虫草的空间分布格局变化。
郭彦龙
本数据包含了2019年度,在色林错和纳木错周遭地区,共21个湖泊的底栖动物数据,采样主要在沿岸带使用底拖网和深水区使用Ekman采集器,将两种途径获取的材料整合之后,给出了各个湖泊底栖动物数据相对丰度,主要湖泊底栖种类分别为湖沼钩虾、水龟虫和摇蚊幼虫,但是螺类以及介形类出现频率较低,可能与采样点设置有关。该数据进一步将不同类型的底栖划分为21个分类单元,提高了识别精度和认知范围,将为高原湖泊水生动物多样性和渔业资源评估提供参考。
唐红渠
植被净初级生产力(Net Primary Production,NPP)是维系人类及异养有机体生命的基础资源,是衡量生态系统结构特征与承载能力的基础指标。本数据采用基于植被光合呼吸模型(Vegetation Photosynthesis Model,VPM)研制的2015年植被总初级生产力(Gross Primary Production,GPP)数据,通过自养呼吸比率计算得到NPP数据。数据可用于分析青藏高原的植被生产力的空间分异格局,对青藏高原的生态保护研究具有重要意义。
闫慧敏
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库,本科考队于2018至2019年集中在云南大理、云南香格里拉、西藏芒康、甘肃碌曲、西藏察隅、西藏阿里那曲昌都、新疆和田、新疆伊犁地区采集当地家养动物血液或组织样品,同时拍摄样品对应个体照片。每个文件夹包含1套当地家养动物照片和1个样品信息表。照片以jpg格式存储。信息表记录物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
尹婷婷, 彭旻晟
高原鼢鼠(Eospalax baileyi)是鼹形鼠科、鼢鼠属的动物,长期生活于地下黑暗封闭洞穴中,不冬眠,主要采食植物的地下根系,1年繁殖1次,每胎产仔数1-6只,主要栖息于高寒草甸、草甸化草原、草原化草甸、高寒灌丛、高原农田、荒坡等比较湿润的河岸阶地、山间盆地、滩地和山麓缓坡,仅分布在中国西部和西北部,海拔2800-4500米。分布在高海拔地区的高原鼢鼠不仅面临着地下洞穴的低氧胁迫,还面临着高原低氧的双重压力。长期的低氧生活除了在基因组序列上积累适应性突变,也会在基因组的结构和基因表达调控上体现适应性调控改变,通过分析不同海拔的高原鼢鼠的DNA甲基化和转录组数据,可以尝试解析高原鼢鼠在表观调控和基因表达水平的适应性进化和调控机制。
吕雪梅
班戈、伦坡拉地点的化石研究意义重大,化石的年代数据不可或缺。该地区发育有火山凝灰岩,其中的锆石可用来做U-Pb年龄分析,以此来判断地层及化石的年龄。本数据以图示的方式展示班戈、伦坡拉化石地点凝灰岩样品中的锆石U-Pb年龄分析结果,图中标明了大量锆石的外形,并在不同的锆石样品上标明了年龄分析结果,数据展示了相关研究所采用的较大的样本量,分析结果也较清晰。本数据的图片展示直观清楚,结果可靠,对青藏高原的研究有着较为重大的意义。
孙博阳
2018年产生的蔓菁基因组序列,经过Hi-C测序后的生物信息学分析可以实现将初步组装的基因组草图中的大部分序列定位到染色体,并能够确定这些序列在染色体上的顺序和方向,为获得高质量的序列图谱奠定重要的基础。故课题组通过该技术把蔓菁基因组序列草图中的序列分别划分到同该物种染色体数目一致的群组(Group)中,并且确定每一群组中所有序列的顺序(Order)及方向(Orientation),之后可以结合参考蔓菁基因组、转录组组装序列(EST序列)、近缘物种及遗传图谱数据对划分群组的准确性及序列之间的顺序和方向进行评估。
段元文
1)数据内容:青藏高原气候变化背景下钩虾预测图;2)数据来源及加工方法:基于西藏地区的钩虾物种名录及其分布基础数据库:包括经纬度、海拔,运用ArcView、Maxent软件制作青藏高原钩虾现在、Mid-Holocene和LGM时期预测图;3)数据质量描述:样品的采集和经纬度、海拔信息经过核对,确保分布数据的质量,分析人员均经过实验室的严格培训;4)数据应用成果及前景:综合分析西藏地区钩虾分布数据、物种多样性和遗传多样性,从进化、遗传的视角探讨气候环境变化对钩虾多样性的影响以及钩虾对环境变化的响应,为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据。
侯仲娥
数据内容:包含青藏高原湖泊采集点,钩虾遗传多样性图,项目对青藏高原及其周边地区620个溪流湖泊开展钩虾样品采集并开展了遗传多样性研究,以期为青藏高原湖泊水资源和生物多样性保护提供基础资料。 数据来源及加工方法:本数据集为第一手数据,自主产生。本数据集中标本采集点为项目组2017至2020年在青藏高原开展了4次采集考察所获得。分子数据是对采集标本提取COI序列,作为分子证据,开展遗传多样性分析;主要仪器为PCR仪,型号为Mastercycler X50s,厂家为eppendorf。 数据质量描述:数据集基本覆盖了青藏高原,并增加青藏高原周边地区的样品。 数据应用成果及前景:为生物多样性保护提供基础数据。
侯仲娥
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物疾病情况,调查青藏高原主要家养动物的疫病情况,对各主要家养动物的主要流行疾病进行抗病和易感个体的遗传样本及肠道微生物样品的采集工作。我们在青海省海西蒙古族藏族自治州乌兰县漠河骆驼场采集骆驼粪便。本数据集是青海省骆驼的肠道微生物16srRNA测序数据。通过提取骆驼粪便的微生物总DNA,设计引物扩增细菌的V3-V4区基因片段,再进行二代高通量测序得到相应数据。本数据集共测序44份样品。本数据集可应用于挖掘抗病个体基因层面的遗传资源,找到相应的候选基因。
段子渊
数据集包含1980,1990,2000,2010,2017年青藏高原草地产草量空间分布。基于中国科学院地理科学与资源研究所具有自主知识产权的生态水文动力模型VIP(Vegetation Interface Process) 模拟了青藏高原草地总初级生产力(GPP),利用经验系数估算了净初级生产力(NPP),将NPP换算为干物质,再根据根冠比估算了干草产量。空间分辨率1公里。该数据集将为草地资源管理、开发、利用以及“以草定畜”策略的制定提供依据。
莫兴国
数据集包含2000年,2010年,2018年青藏高原县级理论载畜量数据和1980年, 1990年, 2000年, 2010年, 2017年县级超载程度。基于地理科学与资源研究所具有自主知识产权的生态水文动力学模型VIP(Vegetation interface process) 模拟的NPP数据计算了产草量数据(1km分辨率),按照县行政区域尺度,计算县域产草量,并根据载畜量计算标准(NY/T 635-2015)计算得到县域范围内的理论载畜量。基于县级实际载畜量数据,计算了超载程度。数据将为草地恢复、管理和利用策略的制定提供借鉴。
莫兴国
根据已获得的基因组数据进行筛选从而得到的候选基因,大部分与生理发育相关,为研究候选基因的具体调节机制,因此进行对应的功能验证试验。因此通过获得相应的转基因小鼠,并对其纯合型和野生型样本的相应组织进行转录组测序(共计22份组织样本,包括大脑、骨髓、肌肉组织)。之后通过对此批转录组数据进行分析,从而完善对候选基因的功能验证,为了解物种在不同地区适应性遗传机制,以及生长发育过程中的生理调节提供有力的资料。
李艳
为了解析蔓菁如何、何时进入青藏高原,探讨蔓菁在青藏高原传播与驯化与早期人类活动的高原定居和古丝绸交流之间的关系,2018年6月,课题组利用三代基因组测序技术,对青海省囊谦县的蔓菁自交F1代品种进行全基因组测序和De Novo组装,得到组装基因组大小为409.69 Mb,Contig N50为1.21 Mb。这一结果可为研究植物扩散与人类活动之间的关系提供遗传基础。同时,这项研究有助于揭示人工驯化和人类选择对蔓菁的遗传分化的影响,以及蔓菁适应高原生态环境的适应性机制。
段元文
数据包括青藏高原地区县域尺度的特色农业分布县数据,为青藏高原特色农业空间布局及发展奠定基础。数据来源于西藏高原特色农产品基地发展规划(2015-2020年)等青藏高原地区各省份的规划文件。数据为县级尺度的特色农业分布,包含的种类有青稞、牦牛、绵羊和枸杞四种农产品,实现了县域尺度特色农业主要农产品的空间化,时间范围设定为2015-2020年,参照数据来源中的各省份的特色农业规划建设时间。数据可以应用于特色农业空间布局现状及未来地区特色农业发展的研究。
史文娇
人类活动造成的全球气候变化是生物多样性的主要威胁之一,预测气候变化对物种分布的可能影响,对生物多样性保护具有重要的意义。我们通过长期野外考察和文献收集,获得了12个青藏高原独有的广布两栖爬行动物的分布数据。为保证数据质量,所有物种文献记录的分布点均有DNA测序数据。之后我们使用最大熵值法(Maxent)构建了物种分布模型,评估模型后预测了未来不同时期的物种潜在分布范围。这一结果为青藏高原生物多样性保护,青藏高原物种遗传多样性保护提供了理论支撑。
车静
1)数据内容:青藏高原钩虾分布图;2)数据来源及加工方法:基于西藏地区的钩虾物种名录及其分布基础数据库:包括经纬度、海拔,运用ArcView软件制作青藏高原钩虾分布图;3)数据质量描述:样品的采集和经纬度、海拔信息经过核对,确保分布数据的质量,分析人员均经过实验室的严格培训;4)数据应用成果及前景:综合分析西藏地区钩虾分布数据、物种多样性和遗传多样性,从进化、遗传的视角探讨气候环境变化对钩虾多样性的影响以及钩虾对环境变化的响应,为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据;5)图例信息:褐色圆圈代表天山分布点;粉色圆圈代表青藏高原面上雅鲁藏布江以北分布点,其分化时间约为2-4个百万年;绿色三角代表雅鲁藏布江以南分布点,其分化时间约为4-6个百万年;黄色圆圈代表喜马拉雅分布点,其分化时间约为3个百万年;橙色正方形代表横断山分布点,其分化时间约为5-7个百万年;蓝色圆点为青藏高原东部分布点。
侯仲娥
结合对青藏高原的野外实地调查,并参考已有文献资料,本数据集归纳了分布于我国青藏高原及周边地区包括西藏、云南、四川、贵州四地的蝮亚科蝮蛇物种名录,以及它们的地理分布。青藏高原及周边地区共有蝮蛇24种,隶属于8属,分布的物种数占中国的蝮蛇物种数67%,有7种为该区域内的特有物种。在川、滇、黔、藏四个地区,以云南分布的蝮蛇物种数量最多,达13种;西藏和重庆分布的物种数量最少,仅有7种。数据集可以为青藏高原及周边区域生物多样性编目提供重要的资料。
郭鹏
1)数据内容:包含纲、目、科中文名、科拉丁名、属中文名、属拉丁名、种拉丁名、种中文名、国家、省、分布地;2)数据来源及加工方法:基于2000至2019年间对青藏高原及泛第三极野外科考,记录该地区淡水甲壳动物钩虾的物种组成和分布范围;3)数据质量描述:样品的采集和检测人员均经过实验室的严格培训。样品采集过程中,低温保存,并在规定的时间内送达实验室。样品在实验室分析过程中,采用重复测定,确保检测数据的质量。4)数据应用成果及前景:以青藏高原湖泊中的优势类群钩虾为研究对象,围绕气候环境变化对生物多样性的影响以及生物对环境变化的响应这一主题,获取青藏高原及泛第三极湖泊水系中钩虾的物种数量、分布、以及遗传数据。
侯仲娥
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