“西南高山峡谷哺乳动物物种与分布数据库”包含横断山区哺乳动物名录、物种保护信息和国内分布信息。名录包含科名、属名、物种名;保护信息包含国家重点保护野生动物等级(2021)、CITES附录(2019)、IUCN红色名录(2021)、中国物种红色名录(2021);分布信息包括是否为中国特有种和物种在国内分布的省区。数据来源于中国科学院昆明动物研究所馆藏标本、项目执行期采集的标本、拍摄的红外相机照片、文献等。数据质量可靠。该数据库可为西南高山峡谷地区哺乳动物的研究和保护提供基础数据支撑。
李权
本数据库为西南高山峡谷两栖爬行动物物种名录及其分布数据,包括本区域近300种两栖爬行动物的9544条分布记录。本数据库的物种分布信息主要获取自野外第一手数据及国内外著名动物网站,如物种2000。此数据主要涉及本地区两栖爬行动物的物种名、目科属名、省市县、小地名、经纬度、海拔等信息。此数据可用于探讨西南高山峡谷的两栖爬行动物区系、区划,亦为西南地区乃至东南亚地区的两栖爬行动物多样性、生态系统等研究奠定了坚实基础。
江建平
西南高山峡谷区是世界上生物多样性热点区域之一,建立生物-气候-地理数据库是研究该区域生物多样性的分布格局和形成原因的前提。在项目组提供的本区域7千余种植物分布信息的基础上,结合气候数据(来源于NCEP Reanalysis Products,https://psl.noaa.gov/data/gridded/data.ncep.reanalysis.surface.html, 1950-2020年平均值),建立西南高山峡谷区生物多样性生态环境综合数据库。生物数据包括动植物科属种名称、采集地经纬度信息等,地理数据包含海拔和坡度,气候数据包括降雨量和气温在内的24个指标。本数据库对研究该区域生物多样性分布规律、现状、形成机制和保育网络规划等提供支撑。
何洪鸣, 赵宏飞, 黄先寒
对雅鲁藏布江中、上游干流及年楚河、多雄藏布、来乌藏布等支流区域展开调查,涉及西藏日喀则市南木林、江孜、亚东、吉隆、萨嘎、仲巴等县。在以往人类活动的空白区如错戳龙湖、多庆湖、仲珠谷、罗垄沟等多个地点发现新的人类活动遗迹点,在30余处地点采集到人类活动的重要石器证据,材质包括黑曜石、碧玉岩、水晶等。后续将通过类型学对这些石器的工艺和来源进行进一步分析,为揭示雅鲁藏布江中上游区域史前人类活动历史的时空变化及与周边文化技术交流情况具有重要意义。
杨晓燕, 高玉
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。我们于2021年在云南省采集了大额牛(独龙牛)血液、心脏、肝脏、脾脏、肺、肾、肌肉、脂肪、大肠、小肠、胃、睾丸组织17个个体共267份酒精、RNAlater保存或液氮冻存样品。本数据集包含样品物种、品种、详细采样地、性别、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以及个体照片。实体样品保存于中国西南野生生物种质资源库动物种质资源库。
李艳
1)数据内容:面对未来气候变化青藏高原10种两栖类爬行类遗传多样性的变化。2)数据来源及加工方法:基于青藏高原10种两栖爬行类条形码数据,结合SDM、MPTP approach等软件构建未来2050年、2070年、2090年等时期的遗传多样性及分布情况。3)数据质量描述:数据质量经过核查,分析数据人员经过实验室严格培训。4)数据应用成果及前景:发现分布于青藏高原北部的两栖爬行类需要在保护上给与更多的关注。
沈文菁
1)数据内容:柴达木盆地沙蜥属和麻蜥属物种名录及其分布数据,包含纲、目、科中文名、科拉丁名、属中文名、属拉丁名、种拉丁名、种中文名、国家、省、市县、镇乡等分布地;2)数据来源及加工方法:基于2007至2021年间对柴达木盆地干旱荒漠区两栖爬行动物野外科考,记录该地区沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种组成和分布范围;3)数据质量描述:标本的调查、采集和鉴定人员均为专业人员,样品的采集信息经过核对,确保分布数据的质量;4)数据应用成果及前景:综合分析柴达木盆地沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种多样性和分布数据,可以为西北荒漠区及亚洲中部干旱区生物多样性编目提供重要资料,为评估生物多样性格局及制定保护策略提供科学依据。
郭宪光
兴都库什山脉(Hindu kush Mountains)是亚洲中部的高大山脉。平均海拔约5000米,最高峰蒂里奇米尔峰海拔7690米,是发源于青藏高原西南部的印度河和发源于帕米尔高原的阿姆河的分水岭。研究该区域人群的遗传结构,有助于深入理解该地区人群的扩散历史和适应高原环境的遗传基础。在本研究中,我们对分布于兴都库什山脉的5个群体的213个个体进行了母系遗传结构的研究。采用线粒体基因组捕获建库和二代测序(Illumina HiSeq X Ten platform)的方法,获得了213个个体的线粒体全基因组序列(平均深度>1000x)。基于系统发育思想,我们对这些数据进行质量控制,确保没有样本污染等质量问题。以修订后的剑桥标准序列参考,进行突变位点的输出。根据世界范围内的人群的线粒体DNA系统发育树(PhyloTree.org),对每个样本进行单倍型类群划分。综合以往发表的现代人群和古代样本的mtDNA数据,系统研究了该地区人群的起源和扩散历史。结果表明,该地区的印欧语系人群的主要母系遗传组分来源于欧亚西部。单倍群W3a1a和J1b1a1等类群可能与印欧语系人群的迁徙有关,说明印欧语系向南亚的扩散可能不仅仅是简单的文化扩张,也伴随着一部分的人群迁徙。此外,研究还表明,巴基斯坦北部可能在印欧语系向南亚的扩散中起着重要的通道作用。
孔庆鹏
本数据集包含三台部署在东北虎豹国家公园的陆生脊椎动物红外相机及环境参量观测数据集。本设备部署在东北虎豹国家公园的两个地点,时间跨度(2020.8-2021.6)。由于设备维护,光照不足等,部分数据不连续,但三台设备的数据可互为补充,可重建出2020.8-2021.6虎豹国家公园内观测点的全部信息。 三台设备中,有两台设备配备了红外相机,分别采集到216张照片及1239张照片,可与上述传感器照片相互匹配后,获得拍照前后的生态因子信息。 1. 虎豹国家公园林区出没的野生动物以及温度、湿度、光照、压强以及网络信号强度信息。采集间隔每半小时一次; 2. 数据来源:"陆生脊椎动物监测设备研制“课题,2016YFC0500104,完成单位:中国科学院动物研究所,原始数据,未加工; 3. 传感器数据采集间隔每半小时一次,温度精度正负0.1度,湿度精度正负0.5%,照片数据分为触发和定时两种,触发数据一般由出没在红外相机视野内的野生动物触发;定时拍照数据根据电池电量情况动态调节,采集间隔在1-12小时之间; 4. 本数据可用于记录保护区内的环境温度,结合红外相机数据,可用于分析野生动物活动节律,共存分析以及分布的限制因子等。
乔慧捷, 乔慧捷
本数据集包含两台部署在祁连山保护区的陆生脊椎动物红外相机及环境参量数据集。本设备部署在祁连山保护区寺大隆附近,时间跨度(2020.8-2021.10)。由于设备维护,光照不足等,部分数据不连续,但两台设备的数据可互为补充,可以重建出2020.8-2021.10祁连山保护区内观测点的全部信息。 两台设备有一台设备配备了红外相机,采集到4994张照片,可与上述传感器照片相互匹配后,或者拍照前后的生态因子信息。由于单个压缩文件较大,故采用分卷压缩,需要将三个压缩文件都下载后方可解压缩。 1. 祁连山保护区内出没的野生动物以及温度、湿度、光照、压强以及网络信号强度信息。采集间隔每半小时一次; 2. 数据来源:"陆生脊椎动物监测设备研制“课题,2016YFC0500104,完成单位:中国科学院动物研究所,原始数据,未加工; 3. 传感器数据采集间隔每半小时一次,温度精度正负0.1度,湿度精度正负0.5%,照片数据分为触发和定时两种,触发数据一般由出没在红外相机视野内的野生动物触发;定时拍照数据根据电池电量情况动态调节,采集间隔在1-12小时之间; 4. 本数据可用于记录保护区内的环境温度,结合红外相机数据,可用于分析野生动物活动节律,共存分析以及分布的限制因子等。
乔慧捷, 乔慧捷
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2021年5月子子课题3在甘肃省白银市靖远县开展家养动物遗传资源调查与采集工作。本次科考共采集当地滩羊耳组织156份、山羊耳组织44份、藏羊耳组织25份,共计225份。同时记录了个体的体长、体高、体重、出生日期、采集日期、年龄、性别等信息,拍摄了个体照片,并通过问卷调查的方式获得了饲养方式、饲养食物情况等信息。
田菲, 田菲
西藏自治区生态资源消耗数据集包括省级-市级-县级三个尺度的2000-2019年生态资源消耗数据,根据西藏自治区实际情况,生态资源消耗主要指农牧业生产活动中消耗的生态资源量。生态资源消耗量计算是基于粮食产量数据、牲畜存栏量数据和畜产品产量数据,结合人类占用净初级生产力(HANPP)的评估方法,将生物量数据转换为碳含量数据,进而测算出生态资源消耗量。生态资源消耗量数据是生态压力与生态承载力研究的基础数据,可以直接揭示人类农牧业生产活动对生态系统带来的压力。
闫慧敏
为解析青藏高原动物多样性格局,并建立相应的兽类标本数据库。子课题2019QZKK05010113 2021年集中在新疆西天山共采集200份当地野生动物普通田鼠、乌拉尔姬鼠等标本及组织样本,实体样品包括动物个体、皮张、组织等200个标本样品信息表和500张照片。本数据集包含1个数据集规范表、1个标本信息表、1个组织样本信息表。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。照片,以jpg格式存储。
蒋学龙
为解析青藏高原动物多样性格局,并建立相应的兽类标本数据库。子课题2019QZKK05010110 2021年集中在四川雅安市、甘孜藏族自治州共采集200份当地野生动物中华姬鼠、社鼠等标本及组织样品,实体样品包括动物个体、皮张、组织等。本数据集包含200个样品信息表和374张照片。本数据集包含1个数据集规范表、1个标本信息表、1个组织样本信息表。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。照片,以jpg格式存储。
陈中正
本植被含水量数据集来源于滦河流域土壤水分遥感试验中的地面同步观测,包括:(1)70 km×12 km 典型试验区(南北航线)的17个样区;(2)165 km×5 km复杂试验区(东北—西南航线)的8个样区;(3)地基微波辐射计观测的6个样区。地物类型包括草地、玉米、土豆、莜麦和胡萝卜。数据测量时间为2018年9月13日到2018年9月26日。植被含水量的测量方法为收获法,行播作物按照长度进行收获,草地按照面积进行收获。本数据集经过称重、烘干和植被含水量计算等步骤处理得到。
郑兴明, 姜涛
冬虫夏草(Ophiocordyceps sinensis)是一种经济价值极高的药用真菌,国家二级野生保护植物,主要分布于青藏高原以及周边高海拔地区的高寒草甸生境中,在该物种的传统产区,虫草收入是农牧民重要的经济收入来源,同时该物种是也青藏高原高寒草地生态系统的重要组成部分。 本数据根据已发表的野外调查和实验数据,以冬虫夏草干燥品腺苷含量为其质量标准,建立了一个综合生态位模型来模拟基准气候条件以及未来4种气候变化情景下4个时间段的冬虫夏草潜在分布区变化以及高质量虫草的空间分布格局变化。
郭彦龙
该数据为2019年西藏色林错和纳木错周边23个湖泊61个点位浮游植物数据,采样时间为2019年8-9月,采样方式为常规浮游植物采样方式,样品采集过程中采集水体样品1升,后经鲁哥氏液固定,静止沉淀后虹吸浓缩后,利用倒置显微镜镜检结果。数据包括硅藻、绿藻、蓝藻、甲藻、裸藻和隐藻等6个门类,共计92种不同浮游植物的密度数据。该数据为原始数据,未经过处理,单位为个/L。该数据可以用于表征这些湖泊敞水区浮游植物的组成、丰度,也可用于计算这些湖泊中浮游植物群落的多样性。
张民
数据内容:新种秦皇锦蛇Elpphe xiphodonta 的论文插图原始数据, 新种秦皇锦蛇系发现于秦岭地区的锦蛇属基干物种,与分布在四川若尔盖的若尔盖锦蛇共同构成狭义锦蛇属的最基干支系。 插图包括标本照、头骨CT扫描图,牙齿细节图,头部鳞片绘图,生境照片,采集地图以及系统发育关系图。 来源:作者直接拍摄或绘制,以Photoshop/ArcGIS软件加工生成 该数据可供后续研究中在标明作者版权的前提下直接引用。
史静耸
本数据包含了2019年度,在色林错和纳木错周遭地区,共21个湖泊的底栖动物数据,采样主要在沿岸带使用底拖网和深水区使用Ekman采集器,将两种途径获取的材料整合之后,给出了各个湖泊底栖动物数据相对丰度,主要湖泊底栖种类分别为湖沼钩虾、水龟虫和摇蚊幼虫,但是螺类以及介形类出现频率较低,可能与采样点设置有关。该数据进一步将不同类型的底栖划分为21个分类单元,提高了识别精度和认知范围,将为高原湖泊水生动物多样性和渔业资源评估提供参考。
唐红渠
数据包含:浮游动物物种名录;浮游动物密度;显微镜镜检;高通量测序;数据完善;为青藏高原湖泊构建原始数据集,浮游动物是湖泊水生态调查不可缺少的环节,在系统中处于承上启下的位置,是食物网物质循环和能量流动的重要载体,系统调查和研究青藏高原湖泊浮游动物的群里组成和生物多样性,对于认知青藏高原湖泊生态系统的稳定性和弹性尤为重要,此外浮游动物对环境变化十分敏感,其结构和功能类群的变化可以指示环境压力的强度和变化幅度。
李芸
植被净初级生产力(Net Primary Production,NPP)是维系人类及异养有机体生命的基础资源,是衡量生态系统结构特征与承载能力的基础指标。本数据采用基于植被光合呼吸模型(Vegetation Photosynthesis Model,VPM)研制的2015年植被总初级生产力(Gross Primary Production,GPP)数据,通过自养呼吸比率计算得到NPP数据。数据可用于分析青藏高原的植被生产力的空间分异格局,对青藏高原的生态保护研究具有重要意义。
闫慧敏
青藏高原城镇化地区生物多样性调查数据集主要包括青海湖流域水鸟多样性调查数据集和植被多样性调查数据集。主要于2020年7-8月,在环青海湖区域设置了24个水鸟观测样地,分布于甘子河湿地、布哈河口等地区,利用望远镜、无人机等手段,记录水鸟种类和种群数量。依据环青海湖区域植被类型设置28个1m×1m样地,主要调查植被类型、频度、生物量。本数据集将为青藏高原重点城镇化地区生态安全屏障优化体系研究提供支持。
陈克龙, 陈治荣
为评估构建农牧昆虫DNA条形码快速鉴定体系,并提出合理的可持续利用建议,2019年至2020年,本课题对采自青藏高原地区主要农牧区的半翅目昆虫、蜜蜂类传粉昆虫、鳞翅目昆虫、寄生蜂等膜翅目天敌、象甲和膜翅目以外类群的天敌昆虫等进行常规DNA提取、使用通用引物进行PCR扩增和测序,获得相关DNA条形码序列2000条。数据以fas文件存储。样品物种、采集地等信息汇总至《第二次青藏科考高原动物多样性保护和可持续利用(2019QZKK0501)标本组织样品信息(2020)》。
乔格侠
本数据包括北极Barrow地区不同年龄冻土土壤细菌物种组成数据,可用来探索土壤微生物对冻土消融的响应及不同年龄冻土的土壤细菌差异;本数据为扩增子测序结果,引物为Earth Microbiome Project 标准引物 515F–806R,扩增范围为V4区,测序平台为Illumina Hiseq PE250; 数据通过质量控制,至少达到Q30水平;本数据用于发表于Cryospshere文章Permafrost thawing exhibits a greater influence on bacterial richness and community structure than permafrost age in Arctic permafrost soils. The Cryosphere, 2020, 14, 3907–3916, https://doi.org/10.5194/tc-14-3907-2020。本数据还可用于三极土壤微生物比较分析研究
孔维栋
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库,本科考队于2018至2019年集中在云南大理、云南香格里拉、西藏芒康、甘肃碌曲、西藏察隅、西藏阿里那曲昌都、新疆和田、新疆伊犁地区采集当地家养动物血液或组织样品,同时拍摄样品对应个体照片。每个文件夹包含1套当地家养动物照片和1个样品信息表。照片以jpg格式存储。信息表记录物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
彭旻晟, 彭旻晟, 尹婷婷, 彭旻晟
为收集青藏高原特色家养动物种质资源,并挖掘影响种质资源品质的分子标记,任务五子课题2019QZKK05010704科考队于2019-2020年在青海海北、海西等地广泛收集青海藏羊和青海细毛羊样品,在乐都农业试验站及青海省三角城种羊场组建第一、二核心群。本数据集包含一个产羔信息表,记录了2074只绵羊产羔记录,信息表包括性别、产羔时间、初生重等基本样品信息、以Excel表形式保存。个体照片以JPG格式保存,由专题汇总提交至“第二次青藏科考高原动物多样性保护和可持续利用(2019QZKK0501)照片视频(2020)”数据集中。本数据集可与实体样品结合使用,依据遗传标记信息,筛选具有优异位点的个体绵羊进行标记辅助选择、扩繁和世代选育,培育特殊种质资源的家系。
赵凯
为调查青藏高原外来鱼类的种类、扩散地点、对于当地土著鱼类的生态影响,任务五动物专题子课题2019QZKK05010304科考队于2019年-2020年调查了拉萨河下游和雅鲁藏布江下游地区。本数据集包含一个样品信息表,样品信息表包括鱼类物种、样点信息、采样时间、采集人等基本样品信息、以Excel表形式保存。一个元数据说明文档,以Excel表形式保存。160张照片以JPG格式保存,由专题汇总提交至“第二次青藏科考高原动物多样性保护和可持续利用(2019QZKK0501)照片视频(2020)”数据集中。
熊文
高山兀鹫是我国鹰形目猛禽中一个独特物种,分布区不广,种群数量不大且呈下降趋势。我国对高山兀鹫的种群数量、分布、栖息地和保护情况迄今尚未进行过系统全面的调查,资源状况模糊不清。为查明该物种的种群数量、栖息地和保护状况,深入研究该物种对青藏高原独特生境的行为适应特征,从而为该物种的有效保护提供科学支持。本科考队在西藏自治区采用机动车样线调查法在一定的时间和距离内计数见到的个体数量,结合徒步调查法观察远离公路进入各类代表性生境。本数据集包含2019年在西藏野外观测路线15条,2020年在西藏野外观测路线25条。观察以高山兀鹫为主,同时也记录观察到的藏狐、岩羊、狼、藏羚羊、藏野驴、藏原羚等动物情况。数据包含样线号、日期、开始时间、结束时间、起点、终点、天气以及观察到动物名称、数量、距离、行为、生境信息。
马强
雪鸡作为青藏高原珍稀濒危动物,其种群遗传多样性和种群结构、种群数量变化动态及其关键影响因素的研究对青藏高原气候变化和人类干扰具有重要价值。为阐明两种雪鸡(藏雪鸡和喜马拉雅雪鸡)种群动态及其关键影响因素,基于3S(GPS、GIS 和RS)理论的样线调查技术,本子课题于2020年7月在祁连山地区记录收集两种雪鸡分布信息,采用最大熵、随机森林等统计模型推断物种分布。完成祁连山-阿尔金山区两种雪鸡遗传资源采集、种群调查和栖息地评估。本数据集包含物种、学名、经纬度、调查区域、调查人、调查日期信息。
张立勋
利用卫星追踪技术,我们对黑颈鹤中部分越冬种群开展追踪工作。通过脚扣法捕捉黑颈鹤后,我们采取背包式方法固定追踪器,追踪器加绑绳,总重量在45克,占黑颈鹤体重不到1%。放飞后,我们以每小时获取1个活动点的采样评论,获取黑颈鹤的追踪数据,并将这些数据绘制在地图上,从而获得黑颈鹤越冬期间的活动轨迹情况。相关结果显示,黑颈鹤对越冬地的选择具有高度的稳定性,初步的分析发现黑颈鹤的越冬地和繁殖地之间,具有强连接线。强的迁徙连接性,预示着黑颈鹤更容易受到环境改变的伤害。这些结果,提示我们,加强越冬栖息地保护的重要性。同时,需要采取多种方法,对黑颈鹤的种群健康和动态开展监测。本数据集包含物种名、地点、时间、经纬度、海拔、速度、温度等信息。
伍和启
高原鼢鼠(Eospalax baileyi)是鼹形鼠科、鼢鼠属的动物,长期生活于地下黑暗封闭洞穴中,不冬眠,主要采食植物的地下根系,1年繁殖1次,每胎产仔数1-6只,主要栖息于高寒草甸、草甸化草原、草原化草甸、高寒灌丛、高原农田、荒坡等比较湿润的河岸阶地、山间盆地、滩地和山麓缓坡,仅分布在中国西部和西北部,海拔2800-4500米。分布在高海拔地区的高原鼢鼠不仅面临着地下洞穴的低氧胁迫,还面临着高原低氧的双重压力。长期的低氧生活除了在基因组序列上积累适应性突变,也会在基因组的结构和基因表达调控上体现适应性调控改变,通过分析不同海拔的高原鼢鼠的DNA甲基化和转录组数据,可以尝试解析高原鼢鼠在表观调控和基因表达水平的适应性进化和调控机制。
吕雪梅
2020年9月5日至9月26日,由子课题负责人张德志等8人组成的中科院动物所鸟类科考分队分别对喜马拉雅地区的日喀则市亚东县亚东沟、定结县陈塘沟和聂拉木县樟木沟进行了考察,顺利完成了本年度的野外科考。该观测数据由鸟类物种名称、观测地点和观测时间组成,既包括了考察的目标区域喜马拉雅地区,同时也含有少量的考察途经地点。采集的鸟类物种数据同时并入了该数据集。相应照片视频汇总至动物专题《第二次青藏科考高原动物多样性保护和可持续利用(2019QZKK0501)照片视频(2020)》数据集。
张德志
为了揭示鸟类多样性分布空间格局,探讨喜马拉雅鸟类群落的构建机制。2020年集中在西藏自治区林芝地区察隅县和墨脱县共采集775个鸟类调查样点信息。本数据集包含1个样点信息表,样点信息表包含4029条鸟类观测数据,每条信息包含物种名、拉丁名、采样地、调查时间、调查人、海拔、生境类型、距离中点距离等基本信息,以excel表形式存储。相应照片视频汇总至动物专题《第二次青藏科考高原动物多样性保护和可持续利用(2019QZKK0501)照片视频(2020)》数据集。
吴飞
采用全球陆表特征参量(叶面积指数LAI)产品,空间分辨率为5 km。该产品使用广义回归神经网络方法,由AVHRR地表反射率数据反演LAI。本研究下载了1981–2017年中亚5国、蒙古国和中国北方每年6-8月的12期LAI数据产品,来源于国家科技基础条件平台——国家地球系统科学数据中心。用ArcGIS软件对这些影像进行裁剪,并计算最大值,由此获得最大LAI的时空数据集。其中,中亚5国包括土库曼斯坦、吉尔吉斯斯坦、哈萨克斯坦、塔吉克斯坦和乌兹别克斯坦;中国北方指中国长江以北地区。
张娜
采用样点法对岗日嘎布山沿海拔梯度的鸟类进行调查,按400米海拔跨度对考察区域分别设置海拔带,北坡从波密县通麦镇至嘎隆寺,由低到高设置了5个海拔带,南坡从墨脱县背崩乡解放大桥至嘎隆拉,由低到高设置了8个海拔带,获取岗日嘎布西北段南北坡鸟类多样性和分布数据,以期对理解这一区域鸟类多样性的形成和维持机制方面取得重大突破,进一步探讨气候变化对鸟类多样性的影响与适应策略、物种多样性对全球变化的响应与保护策略等关键科学问题。
杨晓君
2020年11月,利用网捕法和电捕法采集了青海省青藏高原鱼类,采样区域包含了青海省主要水系。共采集了30个样点,其中12个样点,采集到了鱼类标本685尾,包括高原鳅属裂腹鱼类。本项工作是“建立青藏高原湖泊系统水生生物检测方法”计划中的一个环节,即采用传统的鱼类调查数据以生成湖泊系统的物种列表,后将以此结合高原台面多个湖泊系统的环境水样所获取的高通量分子数据,并测试可视参数(湖泊大小、隔离、地理位置和光谱特性)是否能用于预测水生生物多样性。
刘淑伟
采用夹捕、笼捕和陷阱法调查非飞行小型兽类多样性与垂直分布格局。采用红外相机调查法获取地栖大中型野生动物的出现数据。小型兽类调查累计采集日数达8000个,采集标本526号,组织样品1052份;红外相机调查获得野生动物照片4218张,记录到大中型哺乳动物25种。小型兽类数据包含物种、多度、体重等性状数据、环境梯度数据等,可为理解环境梯度-物种多度-物种性状间的关联及垂直梯度哺乳动物群落构建的生态过程提供数据支撑。红外相机数据主要收集珍稀濒危野生动物的出现数据,可补充区域生物多样性本底,同时为生物多样性热点区及保护关键区识别提供科学依据。
李学友
数据主要包括“一带一路”沿线国家和重点区域的旗舰物种的面(POLYGON)、点(POINT)位分布,数据来源IUCN、GIBF。分布图制作的基础数据底图来源于ArcOnline地图下载。本数据主要用于分析“一带一路”重点区域旗舰物种的空间布局。 1)数据内容:本数据集按“一带一路”重点区域(中亚大湖区、中巴经济走廊、三江源国家公园)旗舰物种分布集成,其中哺乳动物9种、高等植物与真菌15种、鸟类20种、鱼类3种。 2)数据来源及加工方法:基于“一带一路”重点区域的旗舰物种名录及其分布基础数据:包括IUCN红色名录以及GBIF的物种地理空间数据,运用AcrMap软件制作每个物种的分布图,形成图集。 3)数据质量描述:每个物种经严格的文献调查、野外调查等,确定旗舰标准,并经哺乳动物学专家、高等植物学与真菌学专家、鸟类学专家、鱼类学专家,按“旗舰物遴选标准(6个指标中,应至少同时具有其中4个指标)”原则严格筛查打分,遴选出评分>25分的物种进行图集制作。每个物种的地理空间数据的经纬度信息经专业人员核对,并按统一的制图标准制作出图。 4)数据应用成果及前景:考察了“一带一路”重点区域旗舰物种的生存状况、生态价值、人文经济价值等,为“泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设”地区的生态多样性评估和生态保护提供科学依据。
王雨华, 王雨华, 张元明, 张元明, 杨维康, 陈毅峰, 杨维康, 陈毅峰, 屈延华, 陈世龙, 屈延华, 庄会富, 陈世龙, 王亚楠, 庄会富, 林紫红, 王亚楠, 林紫红
数据主要包括“一带一路”沿线国家和重点区域的旗舰物种的面(POLYGON)、点(POINT)位分布,数据来源IUCN、GIBF。分布图制作的基础数据底图来源于ArcOnline地图下载。本数据主要用于分析“一带一路”沿线国家旗舰物种的空间布局。 1)数据内容:本数据集按“一带一路”沿线8个国家(巴基斯坦、尼泊尔、伊朗、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、乌兹别克斯坦、塔吉克斯坦、缅甸)旗舰物种分布集成,其中哺乳动物12种、高等植物1种、鸟类23种、鱼类9种。 2)数据来源及加工方法:基于“一带一路”沿线国家的旗舰物种名录及其分布基础数据:包括IUCN红色名录以及GBIF的物种地理空间数据,运用AcrMap软件制作每个物种的分布图,形成图集。 3)数据质量描述:每个物种经严格的文献调查、野外调查等,确定旗舰标准,并经哺乳动物学专家、高等植物学与真菌学专家、鸟类学专家、鱼类学专家,按“旗舰物遴选标准(6个指标中,应至少同时具有其中4个指标)”原则严格筛查打分,遴选出评分>25分的物种进行图集制作。每个物种的地理空间数据的经纬度信息经专业人员核对,并按统一的制图标准制作出图。 4)数据应用成果及前景:考察了“一带一路”沿线8个国家旗舰物种的生存状况、生态价值、人文经济价值等,为“泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设”地区的生态多样性评估和生态保护提供科学依据。
王雨华, 王雨华, 张元明, 杨维康, 张元明, 陈毅峰, 杨维康, 屈延华, 陈毅峰, 陈世龙, 屈延华, 陈世龙, 庄会富, 王亚楠, 庄会富, 王亚楠, 林紫红, 林紫红
班戈、伦坡拉地点的化石研究意义重大,化石的年代数据不可或缺。该地区发育有火山凝灰岩,其中的锆石可用来做U-Pb年龄分析,以此来判断地层及化石的年龄。本数据以图示的方式展示班戈、伦坡拉化石地点凝灰岩样品中的锆石U-Pb年龄分析结果,图中标明了大量锆石的外形,并在不同的锆石样品上标明了年龄分析结果,数据展示了相关研究所采用的较大的样本量,分析结果也较清晰。本数据的图片展示直观清楚,结果可靠,对青藏高原的研究有着较为重大的意义。
孙博阳
1)数据内容:塔里木盆地沙蜥属和麻蜥属物种名录及其分布数据,包含纲、目、科中文名、科拉丁名、属中文名、属拉丁名、种拉丁名、种中文名、国家、省、市县分布地;2)数据来源及加工方法:基于2008至2020年间对塔里木盆地干旱荒漠区两栖爬行动物野外科考,记录该地区沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种组成和分布范围;3)数据质量描述:标本的调查、采集和鉴定人员均为专业人员,样品的采集信息经过核对,确保分布数据的质量;4)数据应用成果及前景:综合分析塔里木盆地沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种多样性和分布数据,可以为为亚洲中部干旱区生物多样性编目提供重要资料,为评估生物多样性格局及制定保护策略提供科学依据。
郭宪光
2020年4月至2020年8月子子课题3采集了分布于青海省海西蒙古族藏族自治州州海晏县的青海细毛羊耳组织样品51份、海南藏族自治州同德县的欧拉羊血液样品50份、海南藏族自治州同德县的牦牛血液样品50份、西宁市大通回族土族自治县的海东驴血液样品60份,组织样品共计211份。同时,记录了个体的体长、体高、体重、年龄、性别等信息,以及产羔数、毛细度、毛长等经济性状数据,拍摄了个体照片,并通过问卷调查的方式获得了饲养方式、疫病情况等信息。
田菲, 田菲
为了解析蔓菁如何、何时进入青藏高原,探讨蔓菁在青藏高原传播与驯化与早期人类活动的高原定居和古丝绸交流之间的关系,2018年6月,课题组利用三代基因组测序技术,对青海省囊谦县的蔓菁自交F1代品种进行全基因组测序和De Novo组装,得到组装基因组大小为409.69 Mb,Contig N50为1.21 Mb。这一结果可为研究植物扩散与人类活动之间的关系提供遗传基础。同时,这项研究有助于揭示人工驯化和人类选择对蔓菁的遗传分化的影响,以及蔓菁适应高原生态环境的适应性机制。
段元文, 段元文, 段元文
2018年产生的蔓菁基因组序列,经过Hi-C测序后的生物信息学分析可以实现将初步组装的基因组草图中的大部分序列定位到染色体,并能够确定这些序列在染色体上的顺序和方向,为获得高质量的序列图谱奠定重要的基础。故课题组通过该技术把蔓菁基因组序列草图中的序列分别划分到同该物种染色体数目一致的群组(Group)中,并且确定每一群组中所有序列的顺序(Order)及方向(Orientation),之后可以结合参考蔓菁基因组、转录组组装序列(EST序列)、近缘物种及遗传图谱数据对划分群组的准确性及序列之间的顺序和方向进行评估。
段元文, 段元文, 段元文
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2019年12月集中在重庆、山东、江苏、海南地区共采集重庆大足黑山羊、鲁北白山羊、海南黑山羊、徐州苏白山羊、沂蒙黑山羊共5个地方品种共254只山羊共1208份血液或组织样品,其中9只山羊心肝脾肺肾等新鲜组织RNA样品。本数据集包含样品物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。本数据集还包含品种代表个体外观照片,以jpg格式存储。
彭旻晟, 彭旻晟, 彭旻晟
1)数据内容:青藏高原气候变化背景下钩虾预测图;2)数据来源及加工方法:基于西藏地区的钩虾物种名录及其分布基础数据库:包括经纬度、海拔,运用ArcView、Maxent软件制作青藏高原钩虾现在、Mid-Holocene和LGM时期预测图;3)数据质量描述:样品的采集和经纬度、海拔信息经过核对,确保分布数据的质量,分析人员均经过实验室的严格培训;4)数据应用成果及前景:综合分析西藏地区钩虾分布数据、物种多样性和遗传多样性,从进化、遗传的视角探讨气候环境变化对钩虾多样性的影响以及钩虾对环境变化的响应,为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据。
侯仲娥
为研究蔓菁的扩散与人类活动之间的关系,我们将来自青藏高原及周边区域,以及巴基斯坦,印度,尼泊尔,德国,日本等地的蔓菁品种进行重测序,同时对基因家族进行聚类,以及特有、共有基因和基因家族统计,此外还将进行基因家族扩张收缩分析,系统发育树的构建,全基因组复制事件等分析。目的是解析人类活动和区域气候环境双重压力下,高原各地的传统蔓菁品种适应高原的分子基础。因此这项研究有助于揭示蔓菁适应高原生态环境的适应性机制以及在进化过程中人工驯化和人类选择对其遗传分化的影响。
段元文, 段元文, 段元文
数据内容:包含青藏高原湖泊采集点,钩虾遗传多样性图,项目对青藏高原及其周边地区620个溪流湖泊开展钩虾样品采集并开展了遗传多样性研究,以期为青藏高原湖泊水资源和生物多样性保护提供基础资料。 数据来源及加工方法:本数据集为第一手数据,自主产生。本数据集中标本采集点为项目组2017至2020年在青藏高原开展了4次采集考察所获得。分子数据是对采集标本提取COI序列,作为分子证据,开展遗传多样性分析;主要仪器为PCR仪,型号为Mastercycler X50s,厂家为eppendorf。 数据质量描述:数据集基本覆盖了青藏高原,并增加青藏高原周边地区的样品。 数据应用成果及前景:为生物多样性保护提供基础数据。
侯仲娥
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2020年集中在新疆维吾尔自治区伊犁地区共采集209个共707份当地主要驯化动物血液或、组织、粪便样品,其中包括12匹马心肝脾肺肾等RNA样品。本数据集包含新疆伊犁地区绵羊、家马、黄牛、家犬、家鸡、家鹅、山羊等物种的物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。本数据集还包含采样个体外观照片,以jpg格式存储。
徐峰
为描述青藏高原及周边地区(泛第三极地区)主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景。2020年我们选取31个肯尼亚当地商品鸡和土鸡肾、脾、空肠RNA组织样品,提取总RNA后建库并做转录组测序。测序产生了一批180G转录组测序原始数据。为探索泛第三极地区家鸡驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据,并进一步探讨驯化动物对干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。本数据集包含31个家鸡个体物种、品种、性别、表型等基本样品信息excel表,和31个家鸡个体3种组织转录组测序原始数据及MD5值。
彭旻晟, 彭旻晟, 彭旻晟
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