青藏高原与西北干旱区33个湖泊表层沉积植物DNA数据-时空三极环境大数据平台

数据包括青藏高原与西北干旱区33个湖泊表层沉积物中植物DNA的原始测序文件。我们使用德国Qiagen公司的PowerMax土壤试剂盒提取DNA，并采用通用植物引物g-h (Taberlet et al., 2007) 对样品中叶绿体trnL (UAA) 内含子区的P6环进行PCR扩增，PCR产物随后送至瑞士Fasteris公司进行第二代高通量双端测序，测序仪器为Illumina NextSeq 550。数据质量分数Q30为81.97。

数据使用方法

数据为fastq文件，建议使用OBITOOLS等生物信息学工具进行读取并分析，具体可参考：https://datadryad.org/stash/dataset/doi:10.5061/dryad.k6djh9w4r。

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文章的引用

1. 贾伟瀚. (2020). 青藏高原与西北干旱区湖泊沉积物中植物DNA的现代过程研究. 北京: 首都师范大学.(查看)

2. Stoof-Leichsenring, K.R., Liu, S., Jia, W., Li, K., & La, P. (2020). Plant diversity in sedimentary dna obtained from high-latitude (siberia) and high-elevation lakes (china). Biodiversity Data Journal, 8, e57089.(查看)

数据的引用

刘兴起, 贾伟瀚. (2021). 青藏高原与西北干旱区33个湖泊表层沉积植物DNA数据. 国家青藏高原科学数据中心, 2021. doi: https://doi.org/10.5061/dryad.k6djh9w4r.
[Liu, X., Jia, W. (2021). Data of plant DNA in surface sediments of 33 lakes in Qinghai-Tibetan Plateau and arid northwestern China. National Tibetan Plateau Data Center, 2021]

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关键词

学科：陆地表层
主题：植被植物多样性
地点：青藏高原西北干旱区
时间：空

空间位置

East: 116.51	West: 81.24
South: 29.21	North: 47.10

数据细节

文件列表
/190128_NB501850_A_L1-4_ALRK-3_R1.fastq.gz 大小：1.5 GB

/190128_NB501850_A_L1-4_ALRK-3_R2.fastq.gz 大小：1.6 GB
时间分辨率：Yearly
空间分辨率：-
大小：3173.0 MB
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共享方式： 开放获取
元数据更新时间：2021-12-16