现代藏族人群全基因组变异数据-时空三极环境大数据平台

青藏高原平均海拔4000米以上，高寒、低氧等恶劣环境对人类的生存构成了巨大的挑战。然而，高原藏族人群自旧石器晚期就已经达到青藏高原，并且在新石器时期进一步大规模永久定居高海拔地区。因此，青藏高原的人群迁徙历史成为了近年来不同领域关注的焦点。为从全基因组的角度解析藏族人群的遗传结构，追溯人类定居高原的历史，我们获得了20个藏族个体的全基因组变异数据开展研究。采用DNA 微阵列（DNA Array）的方法，对20个样本进行了SNP分型检测，获得每个样品约70万位点（包括核基因组、线粒体DNA和Y染色体）分型结果。基于上述数据，进行相关生物信息分析（主要包括芯片位点质控分析、Y染色体和线粒体DNA的单倍群分型分析）。该数据有助于从核基因组、Y染色体和线粒体DNA的角度，解析藏族人群的遗传结构，通过与高原周边人群数据的比较，可以较为全面地追溯高原人群的迁徙和定居历史。

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孔庆鹏. (2020). 现代藏族人群全基因组变异数据. 国家青藏高原科学数据中心, 2020. doi: 10.11888/Ecolo.tpdc.270370.
[Kong, Q. (2020). Genomic variation data of modern Tibetans. National Tibetan Plateau Data Center, 2020]

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资助项目

泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设专项

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关键词

学科：人地关系
主题：人口藏族人群
地点：青藏高原
时间： 2018-2019

空间位置

East: 97.65	West: 85.52
South: 28.05	North: 32.28

数据细节

文件列表
/1176.vcf 大小：40.5 MB

/1177.vcf 大小：40.5 MB

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时间分辨率：Yearly
空间分辨率：<= 1 m
大小：809.0 MB
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下载量：1 次
数据时间范围：2018-04-06 至 2020-01-05
共享方式： 保护期内
元数据更新时间：2021-04-19
保护期已过了329.0%

联系信息

孔庆鹏

分发方：时空三极环境大数据平台

Email： poles@itpcas.ac.cn

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