日喀则藏族Y染色体SNP分型数据（2016-2019）-时空三极环境大数据平台

为研究日喀则藏族人群的父系遗传结构，我们采集了434个日喀则藏族个体。首先，通过SNP分型的方法，确定了每个样本的单倍群归属。其次，采用ABI 3130XL，用荧光标记引物对8个STR位点进行检测，以进一步研究该人群的Y染色体遗传多样性。结果表明，日喀则藏族人群中的O-M175频率最高（47.00%，其中O2-M122最多（41.47%）），其次是D-M174（40.78%，以D-P47（20.97%）和D-N1（16.82%）为主）。此外，还有C-M217（1.84%），R1a1- M17（1.61%），N1-LLY22G（5.76%），Q-M242（0.69%），以及E、J、K-M、T等。本数据及和去年发布的拉萨藏族Y染色体数据相整合，能够实现不同藏族人群的遗传结构的比较，进而通过系统发育以及溯祖分析，能够揭示不同藏族人群的群体历史。

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1. Qi, X.B., Cui, C.Y., Peng, Y., Zhang, X.M., Yang, Z.H., Zhong, H., Zhang, H., Xiang, K., Cao, X.Y., Wang, Y., et al. (2013). Genetic Evidence of Paleolithic Colonization and Neolithic Expansion of Modern Humans on the Tibetan Plateau, Molecular Biology and Evolution, Volume 30, Issue 8, August 2013, Pages 1761–1778, https://doi.org/10.1093/molbev/mst093.(查看)

数据的引用

孔庆鹏, 祁学斌. (2020). 日喀则藏族Y染色体SNP分型数据（2016-2019）. 国家青藏高原科学数据中心, 2020. doi: https://doi.org/10.1093/molbev/mst093.
[Kong, Q., Qi, X. (2020). Y chromosome SNP and STR data of Tibetans from Shigatse (2016-2019). National Tibetan Plateau Data Center, 2020]

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数据时间范围：2016-05-05 至 2019-08-02
共享方式： 申请获取
元数据更新时间：2021-04-19

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孔庆鹏、祁学斌

分发方：时空三极环境大数据平台

Email： poles@itpcas.ac.cn

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