青藏高原藏族人群线粒体基因组测序数据集(V1.0)(2018)

Mitochondrial DNA genome sequencing dataset of Tibetans for the Tibetan Plateau (Version 1.0) (2018)


采用高通量二代测序的方法,对671个藏族样本进行线粒体全基因组测序。测序平均深度1000×,确保每个样本的线粒体基因组完全覆盖(覆盖度100%)。基于系统发育思想,我们对这些数据进行质量控制,确保没有样本污染等质量问题。结合已发表的欧亚大陆其他人群的测序数据,系统研究藏族人群的母系遗传结构及其形成机制。结果表明,藏族人群中有20.98%可追溯至5.2-4.0 ka,与粟黍农业扩散至青藏高原的时间吻合。进一步分析表明,这些组分很可能于10-7 ka前起源于中国北方,与粟黍农业的起源和强化一致。因此,这些组分很可能代表了伴随粟黍农业传播进入青藏高原的粟黍农业人群。通过估算,这些组分在5.2-4.0 ka占藏族人群的40-50%。说明粟黍农业人群得迁徙极大地促进了对藏族人群的遗传结构形成。

数据使用方法

fas格式,可以采用文字编辑器(如Editplus)和MEGA等打开查看和分析.


本数据要求的引用方式
数据的引用

孔庆鹏. (2018). 青藏高原藏族人群线粒体基因组测序数据集(V1.0)(2018). 国家青藏高原科学数据中心, 2018. doi: 10.11888/Paleoenv.tpdc.270255.
[Kong, Q. (2018). Mitochondrial DNA genome sequencing dataset of Tibetans for the Tibetan Plateau (Version 1.0) (2018). National Tibetan Plateau Data Center, 2018]

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  • 数据时间范围:2018-01-05 至 2019-01-04
  • 共享方式: 开放获取
  • 元数据更新时间:2021-04-19
联系信息

孔庆鹏

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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