沙冬青干旱胁迫响应的转录组学特征-时空三极环境大数据平台

通过Hiseq2000对沙冬青叶片和根系进行高通量转录组测序，发现了44959个unigene。并通过数据库比对，对其中的43192个unigene进行功能注释。发现干旱处理下，在叶片和根中差异表达的基因（表达量上调或下调2倍以上）分别有1035个和1210个。这些差异表达的基因集中于与物质运输、胁迫响应以及代谢过程，分子结构活性等方面。鉴定出干旱胁迫下差异表达的（专一性）响应基因40个。通过对沙冬青转录因子的分析，还发现沙冬青包含50个转录因子家族，1575个转录因子。在叶片中7个转录因子表达量上升，50个下降；在根中有11上升，33个下降。

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苏彦华. (2016). 沙冬青干旱胁迫响应的转录组学特征. 国家青藏高原科学数据中心, 2016. doi: doi:10.3972/heihe.096.2013.db.
[Su, Y. (2016). Drought-response transcriptome of ammopiptanthus mongolicus. National Tibetan Plateau Data Center, 2016]

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资助项目

干旱环境下植物水分利用特征及其适应水分胁迫的分子机制研究

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关键词

学科：陆地表层
主题：植被沙冬青生理指标
地点：黑河流域
时间： 2012

空间位置

East: 103.11	West: 103.11
South: 38.63	North: 38.63

数据细节

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数据时间范围：2018-11-19 至 2018-11-19
共享方式： 开放获取
元数据更新时间：2021-04-19