青藏高原地区主要家养动物流行病学调研数据集（2018）-时空三极环境大数据平台

对以西藏、青海为主的青藏高原覆盖地区的家养动物（牦牛、藏羊、骆驼、马等共405份粪便样品）进行隐孢子虫（Cryptosporidium spp.）和微孢子虫（E. bieneusi）进行了巢式PCR检测。1、隐孢子虫的总体感染率为2.96%（12/405），在青海地区的骆驼、藏羊和牦牛中的检出率分为15%、9.8%及3.1%。在云南地区的牦牛中检测率为3.1%。而西藏和云南地区的其他家养动物中未检出。青海骆驼中检出两种隐孢子虫亚种，其中C.bovis亚型为首次在骆驼中检出；在云南牦牛中首次检出C.ryanae亚型。

微孢子虫（E. bieneusi）在青藏高原地区家养动物中的总体检出率为19.75%（80/405），共检出9种已知亚型和一种新亚型（YN）。其中检出率最高的为青海地区骆驼（45%），其次为蒙古羊（42.1%）、牦牛（37.5%）、马（15.62%）、藏羊（7.3%）。而西藏地区藏羊的检出率为10.8%。云南地区中山羊和黄牛中的检出率分别为36%和25.7%。在青海马中首次检测出CAM2亚型，牦牛中首次检测到CAM1亚型；云南黄牛中检测一种新亚型YN。

数据使用方法

贾第虫序列,微孢子虫序列,隐孢子虫序列。word形式，可以采用word打开查看。

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文章的引用

1. 段子渊. 青藏高原地区主要家养动物流行病学调研数据集。丝绸之路专项元数据共享与集成平台. 2018.(查看)

数据的引用

张志超, 段子渊. (2019). 青藏高原地区主要家养动物流行病学调研数据集（2018）. 国家青藏高原科学数据中心, 2019. doi: 10.11888/Ecolo.tpdc.270518.
[Zhang, Z., Duan, Z. (2019). Dataset of major domestic animal epidemiology in Tibetan Plateau (2018). National Tibetan Plateau Data Center, 2019]

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参考文献

1.张庆勋，张瑞莹，张志超，段子渊*，青藏高原主要家养动物流行病学调研.( 查看 )

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数据时间范围：2018-05-08 至 2018-05-08
共享方式： 开放获取
元数据更新时间：2021-04-19

联系信息

张志超、段子渊

分发方：时空三极环境大数据平台

Email： poles@itpcas.ac.cn

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