青藏高原10个古环境DNA测序数据

DNA sequencing data of 10 ancient environmental samples on Tibet Plateau


1) 数据内容:该数据是对青藏高原雅江下游包括:昌果沟、立定、列那和曲贡等4个考古遗址点研究产生的古环境DNA数据,包括4个考古遗址点中10个古环境样本的HiseqX宏基因组测序。可以用来研究青藏高原考古遗址中古环境DNA的研究方法和可行性,及其在古代农业发展历程研究中可能具有的重要作用。

2) 数据来源及加工方法:课题组自有数据,利用Pair-end建库测序方法和illumina HiseqX测序平台检测获取。

3) 数据质量:279M数据量,Q30>85%。

4) 数据应用成果及前景:数据用于在古环境DNA水平揭示青藏高原古代农业的特征。


数据使用方法

数据按照合作单位的英文简称和实验顺序进行命名,采用生物信息学软件如Holi Pipeline进行分析。


数据的引用

杨晓燕. (2019). 青藏高原10个古环境DNA测序数据. 国家青藏高原科学数据中心, 2019. doi: 10.11888/Paleoenv.tpdc.270388.
[Yang, X. (2019). DNA sequencing data of 10 ancient environmental samples on Tibet Plateau. National Tibetan Plateau Data Center, 2019]

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License: This work is licensed under an Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)



资助项目

第二次青藏高原综合科学考察研究

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数据细节

  • 时间分辨率:Yearly
  • 空间分辨率:1km - 10km
  • 大小:279.0 MB
  • 浏览:2153 次
  • 下载量:105 次
  • 数据时间范围:2019-05-08 至 2020-01-01
  • 共享方式: 开放获取
  • 元数据更新时间:2021-04-20

联系信息

杨晓燕

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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